Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms