Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LNPKQ9C0E8 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms