Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms