Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms