Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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COL25A1Q9BXS0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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COL25A1Q9BXS0 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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COL25A1Q9BXS0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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