Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms