Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms