Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM43Q9BTV4 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM43Q9BTV4 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM43Q9BTV4 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM43Q9BTV4 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM43Q9BTV4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM43Q9BTV4 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM43Q9BTV4 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM43Q9BTV4 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM43Q9BTV4 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM43Q9BTV4 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM43Q9BTV4 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM43Q9BTV4 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM43Q9BTV4 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM43Q9BTV4 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM43Q9BTV4 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM43Q9BTV4 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM43Q9BTV4 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM43Q9BTV4 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM43Q9BTV4 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM43Q9BTV4 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM43Q9BTV4 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM43Q9BTV4 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM43Q9BTV4 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM43Q9BTV4 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM43Q9BTV4 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM43Q9BTV4 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM43Q9BTV4 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM43Q9BTV4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM43Q9BTV4 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM43Q9BTV4 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM43Q9BTV4 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM43Q9BTV4 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM43Q9BTV4 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM43Q9BTV4 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM43Q9BTV4 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM43Q9BTV4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM43Q9BTV4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM43Q9BTV4 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM43Q9BTV4 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM43Q9BTV4 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM43Q9BTV4 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM43Q9BTV4 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM43Q9BTV4 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM43Q9BTV4 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM43Q9BTV4 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM43Q9BTV4 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM43Q9BTV4 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM43Q9BTV4 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM43Q9BTV4 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM43Q9BTV4 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM43Q9BTV4 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM43Q9BTV4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM43Q9BTV4 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM43Q9BTV4 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM43Q9BTV4 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM43Q9BTV4 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM43Q9BTV4 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM43Q9BTV4 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM43Q9BTV4 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM43Q9BTV4 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM43Q9BTV4 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM43Q9BTV4 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM43Q9BTV4 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM43Q9BTV4 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM43Q9BTV4 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM43Q9BTV4 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM43Q9BTV4 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM43Q9BTV4 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM43Q9BTV4 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM43Q9BTV4 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM43Q9BTV4 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM43Q9BTV4 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM43Q9BTV4 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM43Q9BTV4 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM43Q9BTV4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM43Q9BTV4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM43Q9BTV4 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM43Q9BTV4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM43Q9BTV4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM43Q9BTV4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM43Q9BTV4 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM43Q9BTV4 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM43Q9BTV4 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM43Q9BTV4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM43Q9BTV4 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM43Q9BTV4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM43Q9BTV4 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM43Q9BTV4 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM43Q9BTV4 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM43Q9BTV4 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM43Q9BTV4 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM43Q9BTV4 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM43Q9BTV4 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM43Q9BTV4 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM43Q9BTV4 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM43Q9BTV4 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM43Q9BTV4 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM43Q9BTV4 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM43Q9BTV4 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms