Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms