Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms