Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCF12Q99081 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms