Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK4

BBS4, Bardet-Biedl syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS4Q96RK4 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BBS4Q96RK4 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms