Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YTHDC1Q96MU7 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms