Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.3 ms