Protein–RNA interactions for Protein: Q96M02

C10orf90, Centrosomal protein C10orf90, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf90Q96M02 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C10orf90Q96M02 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms