Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPNS2Q96L46 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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