Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAVIN3Q969G5 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAVIN3Q969G5 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms