Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTTNBP2Q8WZ74 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CTTNBP2Q8WZ74 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms