Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI8

TMC1, Transmembrane channel-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC1Q8TDI8 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC1Q8TDI8 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMC1Q8TDI8 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMC1Q8TDI8 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMC1Q8TDI8 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMC1Q8TDI8 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMC1Q8TDI8 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMC1Q8TDI8 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMC1Q8TDI8 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMC1Q8TDI8 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC1Q8TDI8 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC1Q8TDI8 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC1Q8TDI8 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC1Q8TDI8 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC1Q8TDI8 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC1Q8TDI8 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC1Q8TDI8 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC1Q8TDI8 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC1Q8TDI8 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC1Q8TDI8 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC1Q8TDI8 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC1Q8TDI8 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC1Q8TDI8 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC1Q8TDI8 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC1Q8TDI8 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC1Q8TDI8 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC1Q8TDI8 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC1Q8TDI8 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms