Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK8

FAM46D, Putative nucleotidyltransferase FAM46D, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46DQ8NEK8 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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FAM46DQ8NEK8 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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FAM46DQ8NEK8 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM46DQ8NEK8 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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FAM46DQ8NEK8 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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FAM46DQ8NEK8 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM46DQ8NEK8 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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FAM46DQ8NEK8 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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FAM46DQ8NEK8 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46DQ8NEK8 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46DQ8NEK8 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46DQ8NEK8 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46DQ8NEK8 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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FAM46DQ8NEK8 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46DQ8NEK8 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46DQ8NEK8 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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FAM46DQ8NEK8 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46DQ8NEK8 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46DQ8NEK8 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46DQ8NEK8 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46DQ8NEK8 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms