Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF148Q8N7C7 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF148Q8N7C7 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF148Q8N7C7 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF148Q8N7C7 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF148Q8N7C7 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF148Q8N7C7 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF148Q8N7C7 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF148Q8N7C7 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF148Q8N7C7 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF148Q8N7C7 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF148Q8N7C7 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF148Q8N7C7 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms