Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRCQ7RTU9 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms