Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms