Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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USP31Q70CQ4 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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USP31Q70CQ4 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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USP31Q70CQ4 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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USP31Q70CQ4 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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USP31Q70CQ4 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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