Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
SUSD1Q6UWL2 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUSD1Q6UWL2 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms