Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms