Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms