Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTA0

PRAMEF17, PRAME family member 17, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF17Q5VTA0 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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PRAMEF17Q5VTA0 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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PRAMEF17Q5VTA0 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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PRAMEF17Q5VTA0 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF17Q5VTA0 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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