Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms