Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms