Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms