Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms