Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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