Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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