Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF11Q15544 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms