Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms