Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
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