Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCOA4Q13772 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms