Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
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C1orf61Q13536 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1orf61Q13536 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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