Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATRQ13535 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATRQ13535 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
ATRQ13535 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATRQ13535 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
ATRQ13535 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
ATRQ13535 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATRQ13535 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATRQ13535 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATRQ13535 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATRQ13535 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
ATRQ13535 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATRQ13535 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
ATRQ13535 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATRQ13535 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATRQ13535 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATRQ13535 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATRQ13535 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATRQ13535 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATRQ13535 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATRQ13535 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATRQ13535 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATRQ13535 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATRQ13535 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATRQ13535 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATRQ13535 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATRQ13535 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATRQ13535 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATRQ13535 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATRQ13535 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
ATRQ13535 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATRQ13535 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATRQ13535 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATRQ13535 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATRQ13535 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATRQ13535 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATRQ13535 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
ATRQ13535 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATRQ13535 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATRQ13535 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATRQ13535 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATRQ13535 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATRQ13535 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATRQ13535 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATRQ13535 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATRQ13535 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATRQ13535 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATRQ13535 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATRQ13535 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATRQ13535 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATRQ13535 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRQ13535 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRQ13535 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRQ13535 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRQ13535 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRQ13535 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRQ13535 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRQ13535 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRQ13535 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRQ13535 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRQ13535 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRQ13535 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRQ13535 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRQ13535 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRQ13535 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRQ13535 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRQ13535 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRQ13535 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRQ13535 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRQ13535 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRQ13535 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRQ13535 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRQ13535 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRQ13535 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRQ13535 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRQ13535 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRQ13535 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRQ13535 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRQ13535 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRQ13535 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRQ13535 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRQ13535 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRQ13535 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRQ13535 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRQ13535 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRQ13535 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRQ13535 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRQ13535 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRQ13535 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRQ13535 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRQ13535 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRQ13535 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRQ13535 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRQ13535 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRQ13535 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRQ13535 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRQ13535 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRQ13535 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRQ13535 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRQ13535 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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