Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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