Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SP140Q13342 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP140Q13342 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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SP140Q13342 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SP140Q13342 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP140Q13342 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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SP140Q13342 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP140Q13342 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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SP140Q13342 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP140Q13342 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP140Q13342 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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SP140Q13342 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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SP140Q13342 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SP140Q13342 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SP140Q13342 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SP140Q13342 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SP140Q13342 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SP140Q13342 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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SP140Q13342 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SP140Q13342 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SP140Q13342 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SP140Q13342 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SP140Q13342 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SP140Q13342 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SP140Q13342 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SP140Q13342 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SP140Q13342 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SP140Q13342 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SP140Q13342 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SP140Q13342 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SP140Q13342 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SP140Q13342 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SP140Q13342 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SP140Q13342 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SP140Q13342 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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