Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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IFT88Q13099 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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IFT88Q13099 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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IFT88Q13099 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFT88Q13099 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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