Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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