Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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NFX1Q12986 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
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NFX1Q12986 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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NFX1Q12986 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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NFX1Q12986 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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