Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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PTP4A2Q12974 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
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