Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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FOXD4Q12950 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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FOXD4Q12950 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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FOXD4Q12950 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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