Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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