Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
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