Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

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Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
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